昭和26年創業者の星野昌氏が、東京都世田谷区尾山台にホシノ天然酵母パン種研究所を設立。終戦後小麦粉はいち早く自由化されたため、米軍が持ち込んだイーストによる製パン法が普及。パン屋からの戦前の酒種菓子パンの味のパンを作りたいという要望に応え、野生酵母を使ってのパン種（醗酵種）を造り売り出したのが始まり。